bạn không nên sử dụng phpmyadmin cho việc này, bạn nên sử dụng mysqldump. từ dòng lệnh của nó
mysqldump -uMYSQL-USER -h server -pMYSQL-USER database_name > /path-to-export
từ một tập lệnh php
$command = "mysqldump -uMYSQL-USER -h server -pMYSQL-USER database_name > /path-to-export/file.sql";
exec($command, $output, $return_var);
điều này dễ dàng tự động hóa với cronjob