Có - bạn có thể sử dụng một biến thể trên chiến lược được sử dụng để tạo chỉ mục mới trong tập hợp bản sao mà không mất thời gian. Điều này sẽ yêu cầu thành viên ẩn được đưa ra ngoài dòng trong khi (các) chỉ mục được tạo.
Đây là liên kết cho chiến lược: http://docs.mongodb.org/manual/tutorial/build-indexes-on-replica-sets/#procedure
Trong trường hợp của bạn, bạn sẽ tắt thành viên ẩn và khởi động lại ở chế độ độc lập (loại bỏ tùy chọn --replSet và sử dụng số cổng khác). Khi thành viên bị cô lập, bạn có thể điều chỉnh các chỉ mục (loại bỏ những chỉ mục không cần thiết và thêm những chỉ mục mới). Sau khi tạo xong các chỉ mục, hãy khởi động lại thành viên với cổng cũ và tùy chọn --replSet.
Thành viên ẩn sẽ đồng bộ lại với tập hợp bản sao và bạn đã hoàn tất.