Bạn đã có ý tưởng đúng, nhưng trong bước cuối cùng của tổng hợp, điều bạn muốn làm là nhóm tất cả các điểm theo học sinh và tìm giá trị $ min.
Thay đổi hoạt động đường ống cuối cùng thành:
{ $group: {
_id: "$_id",
minScore: {$min: "$scores.score"}
}}