Tôi đã có thể giải quyết vấn đề của mình bằng cách gỡ cài đặt và sau đó cài đặt lại tất cả các thư viện (dưới dạng gói ubuntu), trình thông dịch python, tất cả mã, bằng cách tạo lại cơ sở dữ liệu (bao gồm cài đặt lại postgis) và sau đó khởi động lại hoàn toàn nginx (và do đó gunicorn). Tuy nhiên, không có thư viện nào được cập nhật, vì vậy tôi vẫn không hiểu điều gì thực sự đã xảy ra.
