Có vẻ kỳ lạ là thư mục này không được tạo khi cài đặt - bạn đã thay đổi đường dẫn của tệp socket trong my.cfg theo cách thủ công chưa?
Bạn đã thử chỉ cần tự tạo thư mục này và khởi động lại dịch vụ chưa?
mkdir -p /var/run/mysqld
chown mysql:mysql /var/run/mysqld