Sau khi dành hàng giờ để thử tất cả các loại cài đặt trong tệp cấu hình và khởi động lại mysql hàng chục lần, tôi đã nghĩ ra cách này dường như giải quyết được vấn đề (không thể tìm thấy điều này trong bất kỳ tài liệu nào ở bất kỳ đâu)
MySQLdb.connect(server, username, password, database, local_infile = 1)