Vì bạn đang chạy trên Tomcat nên tôi tưởng tượng cách tốt nhất để truy cập cơ sở dữ liệu là viết một dịch vụ web xử lý giao tiếp giữa ứng dụng và máy chủ.
Dịch vụ web sẽ được viết bằng Java để chạy trên TomCat sử dụng JSP.
Tôi đoán bạn đang cố gắng giao tiếp trực tiếp với cơ sở dữ liệu MySQL (tức là chạy các lệnh SQL trực tiếp trên cơ sở dữ liệu) nhưng tôi không nghĩ bạn có thể làm điều này (mặc dù chưa bao giờ thử hoặc xem xét nó), tôi đã luôn làm theo ấn tượng rằng bạn cần một số mã trên máy chủ để ở giữa.