Gặp phải vấn đề tương tự và vấn đề của tôi là MySQL đã tự cài đặt cấu hình để chạy trên cổng không phải mặc định. Tôi không biết lý do cho điều đó, nhưng để biết MySQL đang chạy trên cổng nào, hãy chạy phần sau trong MySql client:
SHOW GLOBAL VARIABLES LIKE 'PORT';