Chỉ đang thử ở đây (không chắc chắn 100%) nhưng bạn đã thử thêm các cột đích như thế này chưa:
mysql_query("LOAD DATA LOCAL INFILE '".$_FILES['my_file']['tmp_name']."'
INTO TABLE table_tracking FIELDS TERMINATED BY ','
OPTIONALLY ENCLOSED BY '\"'
LINES TERMINATED BY '\n'
(tracking_number,order_id)");
Bạn có ba cột trong bảng của mình và chỉ cung cấp hai dữ liệu.