Bạn phải đặt ngày giờ. Cột đã tạo của bạn sẽ tự động được cập nhật thành dấu thời gian hiện tại khi chèn. Xem tài liệu tại Tự động khởi tạo và cập nhật cho TIMESTAMP .
Tuyên bố của bạn phải là
cursor.execute("""INSERT INTO temps VALUES (%s,%s,CURRENT_TIMESTAMP)""",(avgtemperatures[0],avgtemperatures[1]))