Tôi đã nhận được câu trả lời rõ ràng từ Microsoft tại đây http://social.msdn.microsoft.com/Forums/en-US/ssdt/thread/c66c2296-c94e-4f21-993e-7d3090a596a5
Visual Studio Express 2012 dành cho Web không hỗ trợ Công cụ Dữ liệu Máy chủ Sql mới. Để làm việc với một dự án cơ sở dữ liệu (chuyển đổi từ dbproj cũ hoặc tạo một dự án mới từ đầu), bạn phải sử dụng Visual Studio 2010 Shell. Các lỗi tôi gặp phải từ Quy trình lưu trữ là do các tập lệnh sql không được nhập đúng cách. Dbproj cũ có các tập lệnh sql trong các thư mục tùy ý. Giải pháp là loại trừ tất cả các tập lệnh sql khỏi dự án mà tôi vừa chuyển đổi từ một dbproj, sau đó nhập lại các tập lệnh sql. Khi bạn làm điều đó, dự án sẽ nhận ra chúng và không phát sinh lỗi.