Bạn không cần phải trốn tránh nhiều như vậy. Bạn có thể chỉ sử dụng dấu ngoặc đơn bên ngoài truy vấn và dấu ngoặc kép bên trong, tức là nhưng hãy lưu ý để có loại là hex, nghĩa là "03" chứ không phải "3"
mongodump --host localhost --db test --collection bd --query
'{"_id" : { "$binary" : "ryBRQ+Px0kGRsZofJhHgqg==", "$type" : "03" } }'
