Không hoàn toàn rõ ràng chính xác điều gì đang gây ra sự cố vì bạn đã bỏ qua phần quan trọng nhất - mã ném ngoại lệ đó nhưng nếu thêm thuộc tính mối quan hệ vào lớp PostModel ném cố gắng thêm Foreign_keys tham số cho mối quan hệ gọi như sau:
class PostModel(...):
# ...
subject1_id = Column(db.Column(db.BigInteger, db.ForeignKey(EntitiesModel.id), nullable=False)
subject2_id = Column(db.Column(db.BigInteger, db.ForeignKey(EntitiesModel.id), nullable=False)
subject1 = relationship(EntitiesModel, foreign_keys=subject1_id)
subject2 = relationship(EntitiesModel, foreign_keys=subject2_id)