Có thể xóa khỏi nhiều bảng trong cùng một câu lệnh SQL không?

Không, bạn cần chạy nhiều câu lệnh.

Vì bạn cần xóa khỏi hai bảng, hãy cân nhắc tạo bảng tạm thời gồm các id phù hợp:

SELECT U.Id INTO #RecordsToDelete
FROM Users U
   JOIN LinkingTable J ON U.Id = J.U_Id
...

Và sau đó xóa khỏi từng bảng:

DELETE FROM Users 
WHERE Id IN (SELECT Id FROM #RecordsToDelete)

DELETE FROM LinkingTable
WHERE Id IN (SELECT Id FROM #RecordsToDelete)