Xem ngay Hướng dẫn này có một khóa học video liên quan được tạo bởi nhóm Real Python. Xem nó cùng với hướng dẫn bằng văn bản để hiểu sâu hơn của bạn: Đọc và ghi tệp với gấu trúc
Gấu trúc là một gói Python mạnh mẽ và linh hoạt cho phép bạn làm việc với dữ liệu chuỗi thời gian và có nhãn. Nó cũng cung cấp các phương pháp thống kê, cho phép vẽ biểu đồ và hơn thế nữa. Một tính năng quan trọng của Pandas là khả năng viết và đọc Excel, CSV và nhiều loại tệp khác. Các chức năng như Pandas read_csv()
cho phép bạn làm việc với các tệp một cách hiệu quả. Bạn có thể sử dụng chúng để lưu dữ liệu và nhãn từ các đối tượng Pandas vào một tệp và tải chúng sau này dưới dạng Pandas Series
hoặc DataFrame
phiên bản.
Trong hướng dẫn này, bạn sẽ học:
- Công cụ IO của gấu trúc là gì API là
- Cách đọc và ghi dữ liệu đến và từ các tệp
- Cách làm việc với nhiều định dạng tệp khác nhau
- Cách làm việc với dữ liệu lớn hiệu quả
Hãy bắt đầu đọc và ghi tệp!
Phần thưởng miễn phí: 5 Suy nghĩ khi Làm chủ Python, một khóa học miễn phí dành cho các nhà phát triển Python, cho bạn thấy lộ trình và tư duy mà bạn sẽ cần để nâng các kỹ năng Python của mình lên một cấp độ tiếp theo.
Cài đặt gấu trúc
Mã trong hướng dẫn này được thực thi với CPython 3.7.4 và Pandas 0.25.1. Sẽ rất hữu ích nếu đảm bảo bạn có phiên bản Python và Pandas mới nhất trên máy của mình. Bạn có thể muốn tạo một môi trường ảo mới và cài đặt các phần phụ thuộc cho hướng dẫn này.
Trước tiên, bạn sẽ cần thư viện Pandas. Bạn có thể đã có nó được cài đặt. Nếu không, bạn có thể cài đặt nó bằng pip:
$ pip install pandas
Sau khi quá trình cài đặt hoàn tất, bạn sẽ cài đặt Pandas và sẵn sàng.
Anaconda là một bản phân phối Python tuyệt vời đi kèm với Python, nhiều gói hữu ích như Pandas, và một trình quản lý gói và môi trường được gọi là Conda. Để tìm hiểu thêm về Anaconda, hãy xem Thiết lập Python cho Máy học trên Windows.
Nếu bạn không có gấu trúc trong môi trường ảo của mình, thì bạn có thể cài đặt nó với Conda:
$ conda install pandas
Conda rất mạnh mẽ vì nó quản lý các phần phụ thuộc và các phiên bản của chúng. Để tìm hiểu thêm về cách làm việc với Conda, bạn có thể xem tài liệu chính thức.
Chuẩn bị dữ liệu
Trong hướng dẫn này, bạn sẽ sử dụng dữ liệu liên quan đến 20 quốc gia. Dưới đây là tổng quan về dữ liệu và nguồn bạn sẽ làm việc:
-
Quốc gia được biểu thị bằng tên quốc gia. Mỗi quốc gia đều nằm trong danh sách 10 quốc gia hàng đầu về dân số, diện tích hoặc tổng sản phẩm quốc nội (GDP). Các nhãn hàng cho tập dữ liệu là các mã quốc gia gồm ba chữ cái được xác định trong ISO 3166-1. Nhãn cột cho tập dữ liệu là
COUNTRY
. -
Dân số được biểu thị bằng hàng triệu. Dữ liệu đến từ danh sách các quốc gia và các vùng phụ thuộc theo dân số trên Wikipedia. Nhãn cột cho tập dữ liệu là
POP
. -
Khu vực được biểu thị bằng hàng nghìn km bình phương. Dữ liệu đến từ danh sách các quốc gia và các khu vực phụ thuộc trên Wikipedia. Nhãn cột cho tập dữ liệu là
AREA
. -
Tổng sản phẩm quốc nội được biểu thị bằng hàng triệu đô la Mỹ, theo dữ liệu của Liên hợp quốc cho năm 2017. Bạn có thể tìm thấy dữ liệu này trong danh sách các quốc gia theo GDP danh nghĩa trên Wikipedia. Nhãn cột cho tập dữ liệu là
GDP
. -
Lục địa là Châu Phi, Châu Á, Châu Đại Dương, Châu Âu, Bắc Mỹ hoặc Nam Mỹ. Bạn cũng có thể tìm thấy thông tin này trên Wikipedia. Nhãn cột cho tập dữ liệu là
CONT
. -
Ngày quốc khánh là một ngày kỷ niệm độc lập của một quốc gia. Dữ liệu lấy từ danh sách các ngày độc lập quốc gia trên Wikipedia. Ngày tháng được hiển thị ở định dạng ISO 8601. Bốn chữ số đầu tiên đại diện cho năm, hai số tiếp theo là tháng và hai chữ số cuối cùng là ngày trong tháng. Nhãn cột cho tập dữ liệu là
IND_DAY
.
Đây là cách dữ liệu trông như một bảng:
COUNTRY | POP | VÙNG | GDP | CONT | IND_DAY | |
---|---|---|---|---|---|---|
CHN | Trung Quốc | 1398,72 | 9596,96 | 12234.78 | Châu Á | |
IND | Ấn Độ | 1351.16 | 3287,26 | 2575,67 | Châu Á | 1947-08-15 |
Hoa Kỳ | Hoa Kỳ | 329,74 | 9833.52 | 19485,39 | N.America | 1776-07-04 |
IDN | Indonesia | 268.07 | 1910,93 | 1015,54 | Châu Á | 1945-08-17 |
BRA | Braxin | 210,32 | 8515.77 | 2055.51 | S.America | 1822-09-07 |
PAK | Pakistan | 205,71 | 881,91 | 302.14 | Châu Á | 1947-08-14 |
NGA | Nigeria | 200,96 | 923.77 | 375,77 | Châu Phi | 1960-10-01 |
BGD | Bangladesh | 167,09 | 147,57 | 245,63 | Châu Á | 1971-03-26 |
NGA | Nga | 146,79 | 17098,25 | 1530,75 | 1992-06-12 | |
MEX | Mexico | 126,58 | 1964,38 | 1158,23 | N.America | 1810-09-16 |
JPN | Nhật Bản | 126,22 | 377,97 | 4872,42 | Châu Á | |
DEU | Đức | 83.02 | 357.11 | 3693.20 | Châu Âu | |
FRA | Pháp | 67.02 | 640,68 | 2582,49 | Châu Âu | 1789-07-14 |
GBR | Vương quốc Anh | 66,44 | 242.50 | 2631,23 | Châu Âu | |
ITA | Ý | 60,36 | 301,34 | 1943,84 | Châu Âu | |
ARG | Argentina | 44,94 | 2780.40 | 637,49 | S.America | 1816-07-09 |
DZA | Algeria | 43,38 | 2381,74 | 167,56 | Châu Phi | 1962-07-05 |
CÓ THỂ | Canada | 37,59 | 9984,67 | 1647.12 | N.America | 1867-07-01 |
AUS | Úc | 25,47 | 7692.02 | 1408,68 | Châu Đại Dương | |
KAZ | Kazakhstan | 18,53 | 2724.90 | 159,41 | Châu Á | 1991-12-16 |
Bạn có thể nhận thấy rằng một số dữ liệu bị thiếu. Ví dụ:lục địa cho Nga không được chỉ định vì nó trải dài trên cả Châu Âu và Châu Á. Cũng có một số ngày độc lập bị thiếu vì nguồn dữ liệu bỏ qua chúng.
Bạn có thể sắp xếp dữ liệu này bằng Python bằng cách sử dụng từ điển lồng nhau:
data = {
'CHN': {'COUNTRY': 'China', 'POP': 1_398.72, 'AREA': 9_596.96,
'GDP': 12_234.78, 'CONT': 'Asia'},
'IND': {'COUNTRY': 'India', 'POP': 1_351.16, 'AREA': 3_287.26,
'GDP': 2_575.67, 'CONT': 'Asia', 'IND_DAY': '1947-08-15'},
'USA': {'COUNTRY': 'US', 'POP': 329.74, 'AREA': 9_833.52,
'GDP': 19_485.39, 'CONT': 'N.America',
'IND_DAY': '1776-07-04'},
'IDN': {'COUNTRY': 'Indonesia', 'POP': 268.07, 'AREA': 1_910.93,
'GDP': 1_015.54, 'CONT': 'Asia', 'IND_DAY': '1945-08-17'},
'BRA': {'COUNTRY': 'Brazil', 'POP': 210.32, 'AREA': 8_515.77,
'GDP': 2_055.51, 'CONT': 'S.America', 'IND_DAY': '1822-09-07'},
'PAK': {'COUNTRY': 'Pakistan', 'POP': 205.71, 'AREA': 881.91,
'GDP': 302.14, 'CONT': 'Asia', 'IND_DAY': '1947-08-14'},
'NGA': {'COUNTRY': 'Nigeria', 'POP': 200.96, 'AREA': 923.77,
'GDP': 375.77, 'CONT': 'Africa', 'IND_DAY': '1960-10-01'},
'BGD': {'COUNTRY': 'Bangladesh', 'POP': 167.09, 'AREA': 147.57,
'GDP': 245.63, 'CONT': 'Asia', 'IND_DAY': '1971-03-26'},
'RUS': {'COUNTRY': 'Russia', 'POP': 146.79, 'AREA': 17_098.25,
'GDP': 1_530.75, 'IND_DAY': '1992-06-12'},
'MEX': {'COUNTRY': 'Mexico', 'POP': 126.58, 'AREA': 1_964.38,
'GDP': 1_158.23, 'CONT': 'N.America', 'IND_DAY': '1810-09-16'},
'JPN': {'COUNTRY': 'Japan', 'POP': 126.22, 'AREA': 377.97,
'GDP': 4_872.42, 'CONT': 'Asia'},
'DEU': {'COUNTRY': 'Germany', 'POP': 83.02, 'AREA': 357.11,
'GDP': 3_693.20, 'CONT': 'Europe'},
'FRA': {'COUNTRY': 'France', 'POP': 67.02, 'AREA': 640.68,
'GDP': 2_582.49, 'CONT': 'Europe', 'IND_DAY': '1789-07-14'},
'GBR': {'COUNTRY': 'UK', 'POP': 66.44, 'AREA': 242.50,
'GDP': 2_631.23, 'CONT': 'Europe'},
'ITA': {'COUNTRY': 'Italy', 'POP': 60.36, 'AREA': 301.34,
'GDP': 1_943.84, 'CONT': 'Europe'},
'ARG': {'COUNTRY': 'Argentina', 'POP': 44.94, 'AREA': 2_780.40,
'GDP': 637.49, 'CONT': 'S.America', 'IND_DAY': '1816-07-09'},
'DZA': {'COUNTRY': 'Algeria', 'POP': 43.38, 'AREA': 2_381.74,
'GDP': 167.56, 'CONT': 'Africa', 'IND_DAY': '1962-07-05'},
'CAN': {'COUNTRY': 'Canada', 'POP': 37.59, 'AREA': 9_984.67,
'GDP': 1_647.12, 'CONT': 'N.America', 'IND_DAY': '1867-07-01'},
'AUS': {'COUNTRY': 'Australia', 'POP': 25.47, 'AREA': 7_692.02,
'GDP': 1_408.68, 'CONT': 'Oceania'},
'KAZ': {'COUNTRY': 'Kazakhstan', 'POP': 18.53, 'AREA': 2_724.90,
'GDP': 159.41, 'CONT': 'Asia', 'IND_DAY': '1991-12-16'}
}
columns = ('COUNTRY', 'POP', 'AREA', 'GDP', 'CONT', 'IND_DAY')
Mỗi hàng của bảng được viết như một từ điển bên trong có khóa là tên cột và giá trị là dữ liệu tương ứng. Sau đó, những từ điển này được thu thập dưới dạng các giá trị trong dữ liệu data
bên ngoài từ điển. Các khóa tương ứng cho data
là các mã quốc gia gồm ba chữ cái.
Bạn có thể sử dụng data
này để tạo một phiên bản của gấu trúc DataFrame
. Trước tiên, bạn cần nhập Gấu trúc:
>>> import pandas as pd
Bây giờ bạn đã nhập Gấu trúc, bạn có thể sử dụng DataFrame
hàm tạo và data
để tạo DataFrame
đối tượng.
data
được tổ chức theo cách mà mã quốc gia tương ứng với các cột. Bạn có thể đảo ngược các hàng và cột của DataFrame
với thuộc tính .T
:
>>> df = pd.DataFrame(data=data).T
>>> df
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
CHN China 1398.72 9596.96 12234.8 Asia NaN
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.4 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
RUS Russia 146.79 17098.2 1530.75 NaN 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaN
DEU Germany 83.02 357.11 3693.2 Europe NaN
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.5 2631.23 Europe NaN
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaN
ARG Argentina 44.94 2780.4 637.49 S.America 1816-07-09
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaN
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.9 159.41 Asia 1991-12-16
Bây giờ bạn có DataFrame
của mình đối tượng được điền dữ liệu về từng quốc gia.
Lưu ý: Bạn có thể sử dụng .transpose()
thay vì .T
để đảo ngược các hàng và cột trong tập dữ liệu của bạn. Nếu bạn sử dụng .transpose()
, sau đó bạn có thể đặt tham số tùy chọn copy
để chỉ định xem bạn có muốn sao chép dữ liệu cơ bản hay không. Hành vi mặc định là False
.
Các phiên bản Python cũ hơn 3.6 không đảm bảo thứ tự của các khóa trong từ điển. Để đảm bảo thứ tự của các cột được duy trì cho các phiên bản cũ hơn của Python và Pandas, bạn có thể chỉ định index=columns
:
>>> df = pd.DataFrame(data=data, index=columns).T
Bây giờ bạn đã chuẩn bị dữ liệu của mình, bạn đã sẵn sàng để bắt đầu làm việc với các tệp!
Sử dụng Pandas read_csv()
và .to_csv()
Chức năng
Tệp các giá trị được phân tách bằng dấu phẩy (CSV) là tệp văn bản rõ có .csv
tiện ích mở rộng chứa dữ liệu dạng bảng. Đây là một trong những định dạng tệp phổ biến nhất để lưu trữ lượng lớn dữ liệu. Mỗi hàng của tệp CSV đại diện cho một hàng bảng. Theo mặc định, các giá trị trong cùng một hàng được phân tách bằng dấu phẩy, nhưng bạn có thể thay đổi dấu phân cách thành dấu chấm phẩy, tab, dấu cách hoặc một số ký tự khác.
Viết tệp CSV
Bạn có thể lưu gấu trúc DataFrame
của mình dưới dạng tệp CSV với .to_csv()
:
>>> df.to_csv('data.csv')
Đó là nó! Bạn đã tạo tệp data.csv
trong thư mục làm việc hiện tại của bạn. Bạn có thể mở rộng khối mã bên dưới để xem tệp CSV của bạn trông như thế nào:
,COUNTRY,POP,AREA,GDP,CONT,IND_DAY
CHN,China,1398.72,9596.96,12234.78,Asia,
IND,India,1351.16,3287.26,2575.67,Asia,1947-08-15
USA,US,329.74,9833.52,19485.39,N.America,1776-07-04
IDN,Indonesia,268.07,1910.93,1015.54,Asia,1945-08-17
BRA,Brazil,210.32,8515.77,2055.51,S.America,1822-09-07
PAK,Pakistan,205.71,881.91,302.14,Asia,1947-08-14
NGA,Nigeria,200.96,923.77,375.77,Africa,1960-10-01
BGD,Bangladesh,167.09,147.57,245.63,Asia,1971-03-26
RUS,Russia,146.79,17098.25,1530.75,,1992-06-12
MEX,Mexico,126.58,1964.38,1158.23,N.America,1810-09-16
JPN,Japan,126.22,377.97,4872.42,Asia,
DEU,Germany,83.02,357.11,3693.2,Europe,
FRA,France,67.02,640.68,2582.49,Europe,1789-07-14
GBR,UK,66.44,242.5,2631.23,Europe,
ITA,Italy,60.36,301.34,1943.84,Europe,
ARG,Argentina,44.94,2780.4,637.49,S.America,1816-07-09
DZA,Algeria,43.38,2381.74,167.56,Africa,1962-07-05
CAN,Canada,37.59,9984.67,1647.12,N.America,1867-07-01
AUS,Australia,25.47,7692.02,1408.68,Oceania,
KAZ,Kazakhstan,18.53,2724.9,159.41,Asia,1991-12-16
Tệp văn bản này chứa dữ liệu được phân tách bằng dấu phẩy . Cột đầu tiên chứa các nhãn hàng. Trong một số trường hợp, bạn sẽ thấy chúng không liên quan. Nếu bạn không muốn giữ chúng, thì bạn có thể chuyển đối số index=False
thành .to_csv()
.
Đọc tệp CSV
Sau khi dữ liệu của bạn được lưu trong tệp CSV, bạn có thể muốn tải và sử dụng nó theo thời gian. Bạn có thể làm điều đó với Pandas read_csv()
chức năng:
>>> df = pd.read_csv('data.csv', index_col=0)
>>> df
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
CHN China 1398.72 9596.96 12234.78 Asia NaN
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.39 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
RUS Russia 146.79 17098.25 1530.75 NaN 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaN
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaN
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaN
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaN
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaN
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
Trong trường hợp này, Pandas read_csv()
hàm trả về một DataFrame
mới với dữ liệu và nhãn từ tệp data.csv
, mà bạn đã chỉ định với đối số đầu tiên. Chuỗi này có thể là bất kỳ đường dẫn hợp lệ nào, bao gồm cả URL.
Tham số index_col
chỉ định cột từ tệp CSV có chứa các nhãn hàng. Bạn chỉ định một chỉ số cột dựa trên 0 cho tham số này. Bạn nên xác định giá trị của index_col
khi tệp CSV chứa các nhãn hàng để tránh tải chúng dưới dạng dữ liệu.
Bạn sẽ tìm hiểu thêm về cách sử dụng Gấu trúc với tệp CSV ở phần sau trong hướng dẫn này. Bạn cũng có thể xem Đọc và Viết tệp CSV bằng Python để xem cách xử lý tệp CSV với thư viện Python csv tích hợp sẵn.
Sử dụng gấu trúc để viết và đọc tệp Excel
Microsoft Excel có lẽ là phần mềm bảng tính được sử dụng rộng rãi nhất. Trong khi các phiên bản cũ hơn sử dụng nhị phân .xls
tệp, Excel 2007 đã giới thiệu .xlsx
dựa trên XML mới tập tin. Bạn có thể đọc và ghi tệp Excel trong Pandas, tương tự như tệp CSV. Tuy nhiên, trước tiên bạn cần cài đặt các gói Python sau:
- xlwt để ghi vào
.xls
tệp - openpyxl hoặc XlsxWriter để ghi vào
.xlsx
tệp - xlrd để đọc các tệp Excel
Bạn có thể cài đặt chúng bằng cách sử dụng pip với một lệnh duy nhất:
$ pip install xlwt openpyxl xlsxwriter xlrd
Bạn cũng có thể sử dụng Conda:
$ conda install xlwt openpyxl xlsxwriter xlrd
Xin lưu ý rằng bạn không phải cài đặt tất cả các gói này. Ví dụ:bạn không cần cả openpyxl và XlsxWriter. Nếu bạn chỉ làm việc với .xls
thì bạn không cần bất kỳ tệp nào trong số chúng! Tuy nhiên, nếu bạn chỉ định làm việc với .xlsx
thì bạn sẽ cần ít nhất một trong số chúng, nhưng không cần xlwt
. Hãy dành chút thời gian để quyết định gói nào phù hợp với dự án của bạn.
Viết tệp Excel
Sau khi cài đặt các gói đó, bạn có thể lưu DataFrame
của mình trong tệp Excel có .to_excel()
:
>>> df.to_excel('data.xlsx')
Đối số 'data.xlsx'
đại diện cho tệp đích và, tùy chọn, đường dẫn của nó. Câu lệnh trên sẽ tạo tệp data.xlsx
trong thư mục làm việc hiện tại của bạn. Tệp đó sẽ giống như sau:
Cột đầu tiên của tệp chứa nhãn của các hàng, trong khi các cột khác lưu trữ dữ liệu.
Đọc tệp Excel
Bạn có thể tải dữ liệu từ các tệp Excel bằng read_excel()
:
>>> df = pd.read_excel('data.xlsx', index_col=0)
>>> df
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
CHN China 1398.72 9596.96 12234.78 Asia NaN
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.39 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
RUS Russia 146.79 17098.25 1530.75 NaN 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaN
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaN
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaN
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaN
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaN
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
read_excel()
trả về một DataFrame
mới chứa các giá trị từ data.xlsx
. Bạn cũng có thể sử dụng read_excel()
với bảng tính OpenDocument hoặc .ods
tệp.
Bạn sẽ tìm hiểu thêm về cách làm việc với các tệp Excel ở phần sau trong hướng dẫn này. Bạn cũng có thể xem Sử dụng gấu trúc để đọc tệp Excel lớn bằng Python.
Hiểu về Pandas IO API
Công cụ IO của gấu trúc là API cho phép bạn lưu nội dung của Series
và DataFrame
các đối tượng vào khay nhớ tạm, các đối tượng hoặc tệp thuộc nhiều loại khác nhau. Nó cũng cho phép tải dữ liệu từ khay nhớ tạm, đối tượng hoặc tệp.
Viết tệp
Series
và DataFrame
các đối tượng có các phương thức cho phép ghi dữ liệu và nhãn vào khay nhớ tạm hoặc tệp. Chúng được đặt tên theo mẫu .to_<file-type>()
, trong đó <file-type>
là loại tệp đích.
Bạn đã tìm hiểu về .to_csv()
và .to_excel()
, nhưng có những người khác, bao gồm:
-
.to_json()
-
.to_html()
-
.to_sql()
-
.to_pickle()
Vẫn còn nhiều loại tệp khác mà bạn có thể ghi vào, vì vậy danh sách này chưa đầy đủ.
Lưu ý: Để tìm các phương pháp tương tự, hãy kiểm tra tài liệu chính thức về tuần tự hóa, IO và chuyển đổi liên quan đến Series
và DataFrame
đối tượng.
Các phương thức này có các tham số chỉ định đường dẫn tệp đích nơi bạn đã lưu dữ liệu và nhãn. Điều này là bắt buộc trong một số trường hợp và không bắt buộc trong một số trường hợp khác. Nếu tùy chọn này khả dụng và bạn chọn bỏ qua, thì các phương thức sẽ trả về các đối tượng (như chuỗi hoặc đoạn lặp) với nội dung của DataFrame
phiên bản.
Tham số tùy chọn compression
quyết định cách nén tệp với dữ liệu và nhãn. Bạn sẽ tìm hiểu thêm về nó sau này. Có một số tham số khác, nhưng chúng chủ yếu dành riêng cho một hoặc một số phương pháp. Bạn sẽ không đi vào chi tiết chúng ở đây.
Đọc tệp
Các hàm Pandas để đọc nội dung của tệp được đặt tên bằng mẫu .read_<file-type>()
, trong đó <file-type>
cho biết loại tệp để đọc. Bạn đã thấy Gấu trúc read_csv()
và read_excel()
chức năng. Dưới đây là một số người khác:
-
read_json()
-
read_html()
-
read_sql()
-
read_pickle()
Các hàm này có một tham số chỉ định đường dẫn tệp đích. Nó có thể là bất kỳ chuỗi hợp lệ nào đại diện cho đường dẫn, trên máy cục bộ hoặc trong một URL. Các đối tượng khác cũng được chấp nhận tùy thuộc vào loại tệp.
Tham số tùy chọn compression
xác định kiểu giải nén để sử dụng cho các tệp nén. Bạn sẽ tìm hiểu về nó ở phần sau trong hướng dẫn này. Có các tham số khác, nhưng chúng dành riêng cho một hoặc một số chức năng. Bạn sẽ không đi vào chi tiết chúng ở đây.
Làm việc với các loại tệp khác nhau
Thư viện Pandas cung cấp nhiều khả năng lưu dữ liệu của bạn vào tệp và tải dữ liệu từ tệp. Trong phần này, bạn sẽ tìm hiểu thêm về cách làm việc với tệp CSV và Excel. Bạn cũng sẽ thấy cách sử dụng các loại tệp khác, như JSON, các trang web, cơ sở dữ liệu và các tệp rắc rối trong Python.
Tệp CSV
Bạn đã học cách đọc và ghi tệp CSV. Bây giờ chúng ta hãy tìm hiểu chi tiết sâu hơn một chút. Khi bạn sử dụng .to_csv()
để lưu DataFrame
của bạn , bạn có thể cung cấp một đối số cho tham số path_or_buf
để chỉ định đường dẫn, tên và phần mở rộng của tệp đích.
path_or_buf
là đối số đầu tiên .to_csv()
sẽ lấy. Nó có thể là bất kỳ chuỗi nào đại diện cho một đường dẫn tệp hợp lệ bao gồm tên tệp và phần mở rộng của nó. Bạn đã thấy điều này trong một ví dụ trước. Tuy nhiên, nếu bạn bỏ qua path_or_buf
, rồi đến .to_csv()
sẽ không tạo bất kỳ tệp nào. Thay vào đó, nó sẽ trả về chuỗi tương ứng:
>>> df = pd.DataFrame(data=data).T
>>> s = df.to_csv()
>>> print(s)
,COUNTRY,POP,AREA,GDP,CONT,IND_DAY
CHN,China,1398.72,9596.96,12234.78,Asia,
IND,India,1351.16,3287.26,2575.67,Asia,1947-08-15
USA,US,329.74,9833.52,19485.39,N.America,1776-07-04
IDN,Indonesia,268.07,1910.93,1015.54,Asia,1945-08-17
BRA,Brazil,210.32,8515.77,2055.51,S.America,1822-09-07
PAK,Pakistan,205.71,881.91,302.14,Asia,1947-08-14
NGA,Nigeria,200.96,923.77,375.77,Africa,1960-10-01
BGD,Bangladesh,167.09,147.57,245.63,Asia,1971-03-26
RUS,Russia,146.79,17098.25,1530.75,,1992-06-12
MEX,Mexico,126.58,1964.38,1158.23,N.America,1810-09-16
JPN,Japan,126.22,377.97,4872.42,Asia,
DEU,Germany,83.02,357.11,3693.2,Europe,
FRA,France,67.02,640.68,2582.49,Europe,1789-07-14
GBR,UK,66.44,242.5,2631.23,Europe,
ITA,Italy,60.36,301.34,1943.84,Europe,
ARG,Argentina,44.94,2780.4,637.49,S.America,1816-07-09
DZA,Algeria,43.38,2381.74,167.56,Africa,1962-07-05
CAN,Canada,37.59,9984.67,1647.12,N.America,1867-07-01
AUS,Australia,25.47,7692.02,1408.68,Oceania,
KAZ,Kazakhstan,18.53,2724.9,159.41,Asia,1991-12-16
Bây giờ bạn có chuỗi s
thay vì tệp CSV. Bạn cũng có một số giá trị bị thiếu trong DataFrame
của bạn vật. Ví dụ, lục địa cho Nga và ngày độc lập của một số quốc gia (Trung Quốc, Nhật Bản, v.v.) không có sẵn. Trong khoa học dữ liệu và máy học, bạn phải xử lý các giá trị bị thiếu một cách cẩn thận. Gấu trúc xuất sắc ở đây! Theo mặc định, Pandas sử dụng giá trị NaN để thay thế các giá trị bị thiếu.
Lưu ý: nan
, viết tắt của “not a number”, là một giá trị dấu phẩy động cụ thể trong Python.
Bạn có thể nhận được một nan
giá trị với bất kỳ chức năng nào sau đây:
-
float('nan')
-
math.nan
-
numpy.nan
Lục địa tương ứng với Nga trong df
là nan
:
>>> df.loc['RUS', 'CONT']
nan
Ví dụ này sử dụng .loc[]
để nhận dữ liệu với tên hàng và cột được chỉ định.
Khi bạn lưu DataFrame
của mình vào tệp CSV, các chuỗi trống (''
) sẽ đại diện cho dữ liệu bị thiếu. Bạn có thể thấy điều này cả trong tệp data.csv
của mình và trong chuỗi s
. Nếu bạn muốn thay đổi hành vi này, hãy sử dụng tham số tùy chọn na_rep
:
>>> df.to_csv('new-data.csv', na_rep='(missing)')
Mã này tạo ra tệp new-data.csv
trong đó các giá trị bị thiếu không còn là chuỗi trống. Bạn có thể mở rộng khối mã bên dưới để xem tệp này trông như thế nào:
,COUNTRY,POP,AREA,GDP,CONT,IND_DAY
CHN,China,1398.72,9596.96,12234.78,Asia,(missing)
IND,India,1351.16,3287.26,2575.67,Asia,1947-08-15
USA,US,329.74,9833.52,19485.39,N.America,1776-07-04
IDN,Indonesia,268.07,1910.93,1015.54,Asia,1945-08-17
BRA,Brazil,210.32,8515.77,2055.51,S.America,1822-09-07
PAK,Pakistan,205.71,881.91,302.14,Asia,1947-08-14
NGA,Nigeria,200.96,923.77,375.77,Africa,1960-10-01
BGD,Bangladesh,167.09,147.57,245.63,Asia,1971-03-26
RUS,Russia,146.79,17098.25,1530.75,(missing),1992-06-12
MEX,Mexico,126.58,1964.38,1158.23,N.America,1810-09-16
JPN,Japan,126.22,377.97,4872.42,Asia,(missing)
DEU,Germany,83.02,357.11,3693.2,Europe,(missing)
FRA,France,67.02,640.68,2582.49,Europe,1789-07-14
GBR,UK,66.44,242.5,2631.23,Europe,(missing)
ITA,Italy,60.36,301.34,1943.84,Europe,(missing)
ARG,Argentina,44.94,2780.4,637.49,S.America,1816-07-09
DZA,Algeria,43.38,2381.74,167.56,Africa,1962-07-05
CAN,Canada,37.59,9984.67,1647.12,N.America,1867-07-01
AUS,Australia,25.47,7692.02,1408.68,Oceania,(missing)
KAZ,Kazakhstan,18.53,2724.9,159.41,Asia,1991-12-16
Now, the string '(missing)'
in the file corresponds to the nan
values from df
.
When Pandas reads files, it considers the empty string (''
) and a few others as missing values by default:
'nan'
'-nan'
'NA'
'N/A'
'NaN'
'null'
If you don’t want this behavior, then you can pass keep_default_na=False
to the Pandas read_csv()
hàm số. To specify other labels for missing values, use the parameter na_values
:
>>> pd.read_csv('new-data.csv', index_col=0, na_values='(missing)')
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
CHN China 1398.72 9596.96 12234.78 Asia NaN
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.39 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
RUS Russia 146.79 17098.25 1530.75 NaN 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaN
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaN
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaN
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaN
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaN
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
Here, you’ve marked the string '(missing)'
as a new missing data label, and Pandas replaced it with nan
when it read the file.
When you load data from a file, Pandas assigns the data types to the values of each column by default. You can check these types with .dtypes
:
>>> df = pd.read_csv('data.csv', index_col=0)
>>> df.dtypes
COUNTRY object
POP float64
AREA float64
GDP float64
CONT object
IND_DAY object
dtype: object
The columns with strings and dates ('COUNTRY'
, 'CONT'
, and 'IND_DAY'
) have the data type object
. Meanwhile, the numeric columns contain 64-bit floating-point numbers (float64
).
You can use the parameter dtype
to specify the desired data types and parse_dates
to force use of datetimes:
>>> dtypes = {'POP': 'float32', 'AREA': 'float32', 'GDP': 'float32'}
>>> df = pd.read_csv('data.csv', index_col=0, dtype=dtypes,
... parse_dates=['IND_DAY'])
>>> df.dtypes
COUNTRY object
POP float32
AREA float32
GDP float32
CONT object
IND_DAY datetime64[ns]
dtype: object
>>> df['IND_DAY']
CHN NaT
IND 1947-08-15
USA 1776-07-04
IDN 1945-08-17
BRA 1822-09-07
PAK 1947-08-14
NGA 1960-10-01
BGD 1971-03-26
RUS 1992-06-12
MEX 1810-09-16
JPN NaT
DEU NaT
FRA 1789-07-14
GBR NaT
ITA NaT
ARG 1816-07-09
DZA 1962-07-05
CAN 1867-07-01
AUS NaT
KAZ 1991-12-16
Name: IND_DAY, dtype: datetime64[ns]
Now, you have 32-bit floating-point numbers (float32
) as specified with dtype
. These differ slightly from the original 64-bit numbers because of smaller precision . The values in the last column are considered as dates and have the data type datetime64
. That’s why the NaN
values in this column are replaced with NaT
.
Now that you have real dates, you can save them in the format you like:
>>>>>> df = pd.read_csv('data.csv', index_col=0, parse_dates=['IND_DAY'])
>>> df.to_csv('formatted-data.csv', date_format='%B %d, %Y')
Here, you’ve specified the parameter date_format
to be '%B %d, %Y'
. You can expand the code block below to see the resulting file:
,COUNTRY,POP,AREA,GDP,CONT,IND_DAY
CHN,China,1398.72,9596.96,12234.78,Asia,
IND,India,1351.16,3287.26,2575.67,Asia,"August 15, 1947"
USA,US,329.74,9833.52,19485.39,N.America,"July 04, 1776"
IDN,Indonesia,268.07,1910.93,1015.54,Asia,"August 17, 1945"
BRA,Brazil,210.32,8515.77,2055.51,S.America,"September 07, 1822"
PAK,Pakistan,205.71,881.91,302.14,Asia,"August 14, 1947"
NGA,Nigeria,200.96,923.77,375.77,Africa,"October 01, 1960"
BGD,Bangladesh,167.09,147.57,245.63,Asia,"March 26, 1971"
RUS,Russia,146.79,17098.25,1530.75,,"June 12, 1992"
MEX,Mexico,126.58,1964.38,1158.23,N.America,"September 16, 1810"
JPN,Japan,126.22,377.97,4872.42,Asia,
DEU,Germany,83.02,357.11,3693.2,Europe,
FRA,France,67.02,640.68,2582.49,Europe,"July 14, 1789"
GBR,UK,66.44,242.5,2631.23,Europe,
ITA,Italy,60.36,301.34,1943.84,Europe,
ARG,Argentina,44.94,2780.4,637.49,S.America,"July 09, 1816"
DZA,Algeria,43.38,2381.74,167.56,Africa,"July 05, 1962"
CAN,Canada,37.59,9984.67,1647.12,N.America,"July 01, 1867"
AUS,Australia,25.47,7692.02,1408.68,Oceania,
KAZ,Kazakhstan,18.53,2724.9,159.41,Asia,"December 16, 1991"
The format of the dates is different now. The format '%B %d, %Y'
means the date will first display the full name of the month, then the day followed by a comma, and finally the full year.
There are several other optional parameters that you can use with .to_csv()
:
sep
denotes a values separator.decimal
indicates a decimal separator.encoding
sets the file encoding.header
specifies whether you want to write column labels in the file.
Here’s how you would pass arguments for sep
and header
:
>>> s = df.to_csv(sep=';', header=False)
>>> print(s)
CHN;China;1398.72;9596.96;12234.78;Asia;
IND;India;1351.16;3287.26;2575.67;Asia;1947-08-15
USA;US;329.74;9833.52;19485.39;N.America;1776-07-04
IDN;Indonesia;268.07;1910.93;1015.54;Asia;1945-08-17
BRA;Brazil;210.32;8515.77;2055.51;S.America;1822-09-07
PAK;Pakistan;205.71;881.91;302.14;Asia;1947-08-14
NGA;Nigeria;200.96;923.77;375.77;Africa;1960-10-01
BGD;Bangladesh;167.09;147.57;245.63;Asia;1971-03-26
RUS;Russia;146.79;17098.25;1530.75;;1992-06-12
MEX;Mexico;126.58;1964.38;1158.23;N.America;1810-09-16
JPN;Japan;126.22;377.97;4872.42;Asia;
DEU;Germany;83.02;357.11;3693.2;Europe;
FRA;France;67.02;640.68;2582.49;Europe;1789-07-14
GBR;UK;66.44;242.5;2631.23;Europe;
ITA;Italy;60.36;301.34;1943.84;Europe;
ARG;Argentina;44.94;2780.4;637.49;S.America;1816-07-09
DZA;Algeria;43.38;2381.74;167.56;Africa;1962-07-05
CAN;Canada;37.59;9984.67;1647.12;N.America;1867-07-01
AUS;Australia;25.47;7692.02;1408.68;Oceania;
KAZ;Kazakhstan;18.53;2724.9;159.41;Asia;1991-12-16
The data is separated with a semicolon (';'
) because you’ve specified sep=';'
. Also, since you passed header=False
, you see your data without the header row of column names.
The Pandas read_csv()
function has many additional options for managing missing data, working with dates and times, quoting, encoding, handling errors, and more. For instance, if you have a file with one data column and want to get a Series
object instead of a DataFrame
, then you can pass squeeze=True
to read_csv()
. You’ll learn later on about data compression and decompression, as well as how to skip rows and columns.
JSON Files
JSON stands for JavaScript object notation. JSON files are plaintext files used for data interchange, and humans can read them easily. They follow the ISO/IEC 21778:2017 and ECMA-404 standards and use the .json
sự mở rộng. Python and Pandas work well with JSON files, as Python’s json library offers built-in support for them.
You can save the data from your DataFrame
to a JSON file with .to_json()
. Start by creating a DataFrame
object again. Use the dictionary data
that holds the data about countries and then apply .to_json()
:
>>> df = pd.DataFrame(data=data).T
>>> df.to_json('data-columns.json')
This code produces the file data-columns.json
. You can expand the code block below to see how this file should look:
{"COUNTRY":{"CHN":"China","IND":"India","USA":"US","IDN":"Indonesia","BRA":"Brazil","PAK":"Pakistan","NGA":"Nigeria","BGD":"Bangladesh","RUS":"Russia","MEX":"Mexico","JPN":"Japan","DEU":"Germany","FRA":"France","GBR":"UK","ITA":"Italy","ARG":"Argentina","DZA":"Algeria","CAN":"Canada","AUS":"Australia","KAZ":"Kazakhstan"},"POP":{"CHN":1398.72,"IND":1351.16,"USA":329.74,"IDN":268.07,"BRA":210.32,"PAK":205.71,"NGA":200.96,"BGD":167.09,"RUS":146.79,"MEX":126.58,"JPN":126.22,"DEU":83.02,"FRA":67.02,"GBR":66.44,"ITA":60.36,"ARG":44.94,"DZA":43.38,"CAN":37.59,"AUS":25.47,"KAZ":18.53},"AREA":{"CHN":9596.96,"IND":3287.26,"USA":9833.52,"IDN":1910.93,"BRA":8515.77,"PAK":881.91,"NGA":923.77,"BGD":147.57,"RUS":17098.25,"MEX":1964.38,"JPN":377.97,"DEU":357.11,"FRA":640.68,"GBR":242.5,"ITA":301.34,"ARG":2780.4,"DZA":2381.74,"CAN":9984.67,"AUS":7692.02,"KAZ":2724.9},"GDP":{"CHN":12234.78,"IND":2575.67,"USA":19485.39,"IDN":1015.54,"BRA":2055.51,"PAK":302.14,"NGA":375.77,"BGD":245.63,"RUS":1530.75,"MEX":1158.23,"JPN":4872.42,"DEU":3693.2,"FRA":2582.49,"GBR":2631.23,"ITA":1943.84,"ARG":637.49,"DZA":167.56,"CAN":1647.12,"AUS":1408.68,"KAZ":159.41},"CONT":{"CHN":"Asia","IND":"Asia","USA":"N.America","IDN":"Asia","BRA":"S.America","PAK":"Asia","NGA":"Africa","BGD":"Asia","RUS":null,"MEX":"N.America","JPN":"Asia","DEU":"Europe","FRA":"Europe","GBR":"Europe","ITA":"Europe","ARG":"S.America","DZA":"Africa","CAN":"N.America","AUS":"Oceania","KAZ":"Asia"},"IND_DAY":{"CHN":null,"IND":"1947-08-15","USA":"1776-07-04","IDN":"1945-08-17","BRA":"1822-09-07","PAK":"1947-08-14","NGA":"1960-10-01","BGD":"1971-03-26","RUS":"1992-06-12","MEX":"1810-09-16","JPN":null,"DEU":null,"FRA":"1789-07-14","GBR":null,"ITA":null,"ARG":"1816-07-09","DZA":"1962-07-05","CAN":"1867-07-01","AUS":null,"KAZ":"1991-12-16"}}
data-columns.json
has one large dictionary with the column labels as keys and the corresponding inner dictionaries as values.
You can get a different file structure if you pass an argument for the optional parameter orient
:
>>> df.to_json('data-index.json', orient='index')
The orient
parameter defaults to 'columns'
. Here, you’ve set it to index
.
You should get a new file data-index.json
. You can expand the code block below to see the changes:
{"CHN":{"COUNTRY":"China","POP":1398.72,"AREA":9596.96,"GDP":12234.78,"CONT":"Asia","IND_DAY":null},"IND":{"COUNTRY":"India","POP":1351.16,"AREA":3287.26,"GDP":2575.67,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1947-08-15"},"USA":{"COUNTRY":"US","POP":329.74,"AREA":9833.52,"GDP":19485.39,"CONT":"N.America","IND_DAY":"1776-07-04"},"IDN":{"COUNTRY":"Indonesia","POP":268.07,"AREA":1910.93,"GDP":1015.54,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1945-08-17"},"BRA":{"COUNTRY":"Brazil","POP":210.32,"AREA":8515.77,"GDP":2055.51,"CONT":"S.America","IND_DAY":"1822-09-07"},"PAK":{"COUNTRY":"Pakistan","POP":205.71,"AREA":881.91,"GDP":302.14,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1947-08-14"},"NGA":{"COUNTRY":"Nigeria","POP":200.96,"AREA":923.77,"GDP":375.77,"CONT":"Africa","IND_DAY":"1960-10-01"},"BGD":{"COUNTRY":"Bangladesh","POP":167.09,"AREA":147.57,"GDP":245.63,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1971-03-26"},"RUS":{"COUNTRY":"Russia","POP":146.79,"AREA":17098.25,"GDP":1530.75,"CONT":null,"IND_DAY":"1992-06-12"},"MEX":{"COUNTRY":"Mexico","POP":126.58,"AREA":1964.38,"GDP":1158.23,"CONT":"N.America","IND_DAY":"1810-09-16"},"JPN":{"COUNTRY":"Japan","POP":126.22,"AREA":377.97,"GDP":4872.42,"CONT":"Asia","IND_DAY":null},"DEU":{"COUNTRY":"Germany","POP":83.02,"AREA":357.11,"GDP":3693.2,"CONT":"Europe","IND_DAY":null},"FRA":{"COUNTRY":"France","POP":67.02,"AREA":640.68,"GDP":2582.49,"CONT":"Europe","IND_DAY":"1789-07-14"},"GBR":{"COUNTRY":"UK","POP":66.44,"AREA":242.5,"GDP":2631.23,"CONT":"Europe","IND_DAY":null},"ITA":{"COUNTRY":"Italy","POP":60.36,"AREA":301.34,"GDP":1943.84,"CONT":"Europe","IND_DAY":null},"ARG":{"COUNTRY":"Argentina","POP":44.94,"AREA":2780.4,"GDP":637.49,"CONT":"S.America","IND_DAY":"1816-07-09"},"DZA":{"COUNTRY":"Algeria","POP":43.38,"AREA":2381.74,"GDP":167.56,"CONT":"Africa","IND_DAY":"1962-07-05"},"CAN":{"COUNTRY":"Canada","POP":37.59,"AREA":9984.67,"GDP":1647.12,"CONT":"N.America","IND_DAY":"1867-07-01"},"AUS":{"COUNTRY":"Australia","POP":25.47,"AREA":7692.02,"GDP":1408.68,"CONT":"Oceania","IND_DAY":null},"KAZ":{"COUNTRY":"Kazakhstan","POP":18.53,"AREA":2724.9,"GDP":159.41,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1991-12-16"}}
data-index.json
also has one large dictionary, but this time the row labels are the keys, and the inner dictionaries are the values.
There are few more options for orient
. One of them is 'records'
:
>>> df.to_json('data-records.json', orient='records')
This code should yield the file data-records.json
. You can expand the code block below to see the content:
[{"COUNTRY":"China","POP":1398.72,"AREA":9596.96,"GDP":12234.78,"CONT":"Asia","IND_DAY":null},{"COUNTRY":"India","POP":1351.16,"AREA":3287.26,"GDP":2575.67,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1947-08-15"},{"COUNTRY":"US","POP":329.74,"AREA":9833.52,"GDP":19485.39,"CONT":"N.America","IND_DAY":"1776-07-04"},{"COUNTRY":"Indonesia","POP":268.07,"AREA":1910.93,"GDP":1015.54,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1945-08-17"},{"COUNTRY":"Brazil","POP":210.32,"AREA":8515.77,"GDP":2055.51,"CONT":"S.America","IND_DAY":"1822-09-07"},{"COUNTRY":"Pakistan","POP":205.71,"AREA":881.91,"GDP":302.14,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1947-08-14"},{"COUNTRY":"Nigeria","POP":200.96,"AREA":923.77,"GDP":375.77,"CONT":"Africa","IND_DAY":"1960-10-01"},{"COUNTRY":"Bangladesh","POP":167.09,"AREA":147.57,"GDP":245.63,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1971-03-26"},{"COUNTRY":"Russia","POP":146.79,"AREA":17098.25,"GDP":1530.75,"CONT":null,"IND_DAY":"1992-06-12"},{"COUNTRY":"Mexico","POP":126.58,"AREA":1964.38,"GDP":1158.23,"CONT":"N.America","IND_DAY":"1810-09-16"},{"COUNTRY":"Japan","POP":126.22,"AREA":377.97,"GDP":4872.42,"CONT":"Asia","IND_DAY":null},{"COUNTRY":"Germany","POP":83.02,"AREA":357.11,"GDP":3693.2,"CONT":"Europe","IND_DAY":null},{"COUNTRY":"France","POP":67.02,"AREA":640.68,"GDP":2582.49,"CONT":"Europe","IND_DAY":"1789-07-14"},{"COUNTRY":"UK","POP":66.44,"AREA":242.5,"GDP":2631.23,"CONT":"Europe","IND_DAY":null},{"COUNTRY":"Italy","POP":60.36,"AREA":301.34,"GDP":1943.84,"CONT":"Europe","IND_DAY":null},{"COUNTRY":"Argentina","POP":44.94,"AREA":2780.4,"GDP":637.49,"CONT":"S.America","IND_DAY":"1816-07-09"},{"COUNTRY":"Algeria","POP":43.38,"AREA":2381.74,"GDP":167.56,"CONT":"Africa","IND_DAY":"1962-07-05"},{"COUNTRY":"Canada","POP":37.59,"AREA":9984.67,"GDP":1647.12,"CONT":"N.America","IND_DAY":"1867-07-01"},{"COUNTRY":"Australia","POP":25.47,"AREA":7692.02,"GDP":1408.68,"CONT":"Oceania","IND_DAY":null},{"COUNTRY":"Kazakhstan","POP":18.53,"AREA":2724.9,"GDP":159.41,"CONT":"Asia","IND_DAY":"1991-12-16"}]
data-records.json
holds a list with one dictionary for each row. The row labels are not written.
You can get another interesting file structure with orient='split'
:
>>> df.to_json('data-split.json', orient='split')
The resulting file is data-split.json
. You can expand the code block below to see how this file should look:
{"columns":["COUNTRY","POP","AREA","GDP","CONT","IND_DAY"],"index":["CHN","IND","USA","IDN","BRA","PAK","NGA","BGD","RUS","MEX","JPN","DEU","FRA","GBR","ITA","ARG","DZA","CAN","AUS","KAZ"],"data":[["China",1398.72,9596.96,12234.78,"Asia",null],["India",1351.16,3287.26,2575.67,"Asia","1947-08-15"],["US",329.74,9833.52,19485.39,"N.America","1776-07-04"],["Indonesia",268.07,1910.93,1015.54,"Asia","1945-08-17"],["Brazil",210.32,8515.77,2055.51,"S.America","1822-09-07"],["Pakistan",205.71,881.91,302.14,"Asia","1947-08-14"],["Nigeria",200.96,923.77,375.77,"Africa","1960-10-01"],["Bangladesh",167.09,147.57,245.63,"Asia","1971-03-26"],["Russia",146.79,17098.25,1530.75,null,"1992-06-12"],["Mexico",126.58,1964.38,1158.23,"N.America","1810-09-16"],["Japan",126.22,377.97,4872.42,"Asia",null],["Germany",83.02,357.11,3693.2,"Europe",null],["France",67.02,640.68,2582.49,"Europe","1789-07-14"],["UK",66.44,242.5,2631.23,"Europe",null],["Italy",60.36,301.34,1943.84,"Europe",null],["Argentina",44.94,2780.4,637.49,"S.America","1816-07-09"],["Algeria",43.38,2381.74,167.56,"Africa","1962-07-05"],["Canada",37.59,9984.67,1647.12,"N.America","1867-07-01"],["Australia",25.47,7692.02,1408.68,"Oceania",null],["Kazakhstan",18.53,2724.9,159.41,"Asia","1991-12-16"]]}
data-split.json
contains one dictionary that holds the following lists:
- The names of the columns
- The labels of the rows
- The inner lists (two-dimensional sequence) that hold data values
If you don’t provide the value for the optional parameter path_or_buf
that defines the file path, then .to_json()
will return a JSON string instead of writing the results to a file. This behavior is consistent with .to_csv()
.
There are other optional parameters you can use. For instance, you can set index=False
to forgo saving row labels. You can manipulate precision with double_precision
, and dates with date_format
and date_unit
. These last two parameters are particularly important when you have time series among your data:
>>> df = pd.DataFrame(data=data).T
>>> df['IND_DAY'] = pd.to_datetime(df['IND_DAY'])
>>> df.dtypes
COUNTRY object
POP object
AREA object
GDP object
CONT object
IND_DAY datetime64[ns]
dtype: object
>>> df.to_json('data-time.json')
In this example, you’ve created the DataFrame
from the dictionary data
and used to_datetime()
to convert the values in the last column to datetime64
. You can expand the code block below to see the resulting file:
{"COUNTRY":{"CHN":"China","IND":"India","USA":"US","IDN":"Indonesia","BRA":"Brazil","PAK":"Pakistan","NGA":"Nigeria","BGD":"Bangladesh","RUS":"Russia","MEX":"Mexico","JPN":"Japan","DEU":"Germany","FRA":"France","GBR":"UK","ITA":"Italy","ARG":"Argentina","DZA":"Algeria","CAN":"Canada","AUS":"Australia","KAZ":"Kazakhstan"},"POP":{"CHN":1398.72,"IND":1351.16,"USA":329.74,"IDN":268.07,"BRA":210.32,"PAK":205.71,"NGA":200.96,"BGD":167.09,"RUS":146.79,"MEX":126.58,"JPN":126.22,"DEU":83.02,"FRA":67.02,"GBR":66.44,"ITA":60.36,"ARG":44.94,"DZA":43.38,"CAN":37.59,"AUS":25.47,"KAZ":18.53},"AREA":{"CHN":9596.96,"IND":3287.26,"USA":9833.52,"IDN":1910.93,"BRA":8515.77,"PAK":881.91,"NGA":923.77,"BGD":147.57,"RUS":17098.25,"MEX":1964.38,"JPN":377.97,"DEU":357.11,"FRA":640.68,"GBR":242.5,"ITA":301.34,"ARG":2780.4,"DZA":2381.74,"CAN":9984.67,"AUS":7692.02,"KAZ":2724.9},"GDP":{"CHN":12234.78,"IND":2575.67,"USA":19485.39,"IDN":1015.54,"BRA":2055.51,"PAK":302.14,"NGA":375.77,"BGD":245.63,"RUS":1530.75,"MEX":1158.23,"JPN":4872.42,"DEU":3693.2,"FRA":2582.49,"GBR":2631.23,"ITA":1943.84,"ARG":637.49,"DZA":167.56,"CAN":1647.12,"AUS":1408.68,"KAZ":159.41},"CONT":{"CHN":"Asia","IND":"Asia","USA":"N.America","IDN":"Asia","BRA":"S.America","PAK":"Asia","NGA":"Africa","BGD":"Asia","RUS":null,"MEX":"N.America","JPN":"Asia","DEU":"Europe","FRA":"Europe","GBR":"Europe","ITA":"Europe","ARG":"S.America","DZA":"Africa","CAN":"N.America","AUS":"Oceania","KAZ":"Asia"},"IND_DAY":{"CHN":null,"IND":-706320000000,"USA":-6106060800000,"IDN":-769219200000,"BRA":-4648924800000,"PAK":-706406400000,"NGA":-291945600000,"BGD":38793600000,"RUS":708307200000,"MEX":-5026838400000,"JPN":null,"DEU":null,"FRA":-5694969600000,"GBR":null,"ITA":null,"ARG":-4843411200000,"DZA":-236476800000,"CAN":-3234729600000,"AUS":null,"KAZ":692841600000}}
In this file, you have large integers instead of dates for the independence days. That’s because the default value of the optional parameter date_format
is 'epoch'
whenever orient
isn’t 'table'
. This default behavior expresses dates as an epoch in milliseconds relative to midnight on January 1, 1970.
However, if you pass date_format='iso'
, then you’ll get the dates in the ISO 8601 format. In addition, date_unit
decides the units of time:
>>> df = pd.DataFrame(data=data).T
>>> df['IND_DAY'] = pd.to_datetime(df['IND_DAY'])
>>> df.to_json('new-data-time.json', date_format='iso', date_unit='s')
This code produces the following JSON file:
{"COUNTRY":{"CHN":"China","IND":"India","USA":"US","IDN":"Indonesia","BRA":"Brazil","PAK":"Pakistan","NGA":"Nigeria","BGD":"Bangladesh","RUS":"Russia","MEX":"Mexico","JPN":"Japan","DEU":"Germany","FRA":"France","GBR":"UK","ITA":"Italy","ARG":"Argentina","DZA":"Algeria","CAN":"Canada","AUS":"Australia","KAZ":"Kazakhstan"},"POP":{"CHN":1398.72,"IND":1351.16,"USA":329.74,"IDN":268.07,"BRA":210.32,"PAK":205.71,"NGA":200.96,"BGD":167.09,"RUS":146.79,"MEX":126.58,"JPN":126.22,"DEU":83.02,"FRA":67.02,"GBR":66.44,"ITA":60.36,"ARG":44.94,"DZA":43.38,"CAN":37.59,"AUS":25.47,"KAZ":18.53},"AREA":{"CHN":9596.96,"IND":3287.26,"USA":9833.52,"IDN":1910.93,"BRA":8515.77,"PAK":881.91,"NGA":923.77,"BGD":147.57,"RUS":17098.25,"MEX":1964.38,"JPN":377.97,"DEU":357.11,"FRA":640.68,"GBR":242.5,"ITA":301.34,"ARG":2780.4,"DZA":2381.74,"CAN":9984.67,"AUS":7692.02,"KAZ":2724.9},"GDP":{"CHN":12234.78,"IND":2575.67,"USA":19485.39,"IDN":1015.54,"BRA":2055.51,"PAK":302.14,"NGA":375.77,"BGD":245.63,"RUS":1530.75,"MEX":1158.23,"JPN":4872.42,"DEU":3693.2,"FRA":2582.49,"GBR":2631.23,"ITA":1943.84,"ARG":637.49,"DZA":167.56,"CAN":1647.12,"AUS":1408.68,"KAZ":159.41},"CONT":{"CHN":"Asia","IND":"Asia","USA":"N.America","IDN":"Asia","BRA":"S.America","PAK":"Asia","NGA":"Africa","BGD":"Asia","RUS":null,"MEX":"N.America","JPN":"Asia","DEU":"Europe","FRA":"Europe","GBR":"Europe","ITA":"Europe","ARG":"S.America","DZA":"Africa","CAN":"N.America","AUS":"Oceania","KAZ":"Asia"},"IND_DAY":{"CHN":null,"IND":"1947-08-15T00:00:00Z","USA":"1776-07-04T00:00:00Z","IDN":"1945-08-17T00:00:00Z","BRA":"1822-09-07T00:00:00Z","PAK":"1947-08-14T00:00:00Z","NGA":"1960-10-01T00:00:00Z","BGD":"1971-03-26T00:00:00Z","RUS":"1992-06-12T00:00:00Z","MEX":"1810-09-16T00:00:00Z","JPN":null,"DEU":null,"FRA":"1789-07-14T00:00:00Z","GBR":null,"ITA":null,"ARG":"1816-07-09T00:00:00Z","DZA":"1962-07-05T00:00:00Z","CAN":"1867-07-01T00:00:00Z","AUS":null,"KAZ":"1991-12-16T00:00:00Z"}}
The dates in the resulting file are in the ISO 8601 format.
You can load the data from a JSON file with read_json()
:
>>> df = pd.read_json('data-index.json', orient='index',
... convert_dates=['IND_DAY'])
The parameter convert_dates
has a similar purpose as parse_dates
when you use it to read CSV files. The optional parameter orient
is very important because it specifies how Pandas understands the structure of the file.
There are other optional parameters you can use as well:
- Set the encoding with
encoding
. - Manipulate dates with
convert_dates
andkeep_default_dates
. - Impact precision with
dtype
andprecise_float
. - Decode numeric data directly to NumPy arrays with
numpy=True
.
Note that you might lose the order of rows and columns when using the JSON format to store your data.
HTML Files
An HTML is a plaintext file that uses hypertext markup language to help browsers render web pages. The extensions for HTML files are .html
and .htm
. You’ll need to install an HTML parser library like lxml or html5lib to be able to work with HTML files:
$pip install lxml html5lib
You can also use Conda to install the same packages:
$ conda install lxml html5lib
Once you have these libraries, you can save the contents of your DataFrame
as an HTML file with .to_html()
:
df = pd.DataFrame(data=data).T
df.to_html('data.html')
This code generates a file data.html
. You can expand the code block below to see how this file should look:
<table border="1" class="dataframe">
<thead>
<tr style="text-align: right;">
<th></th>
<th>COUNTRY</th>
<th>POP</th>
<th>AREA</th>
<th>GDP</th>
<th>CONT</th>
<th>IND_DAY</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<th>CHN</th>
<td>China</td>
<td>1398.72</td>
<td>9596.96</td>
<td>12234.8</td>
<td>Asia</td>
<td>NaN</td>
</tr>
<tr>
<th>IND</th>
<td>India</td>
<td>1351.16</td>
<td>3287.26</td>
<td>2575.67</td>
<td>Asia</td>
<td>1947-08-15</td>
</tr>
<tr>
<th>USA</th>
<td>US</td>
<td>329.74</td>
<td>9833.52</td>
<td>19485.4</td>
<td>N.America</td>
<td>1776-07-04</td>
</tr>
<tr>
<th>IDN</th>
<td>Indonesia</td>
<td>268.07</td>
<td>1910.93</td>
<td>1015.54</td>
<td>Asia</td>
<td>1945-08-17</td>
</tr>
<tr>
<th>BRA</th>
<td>Brazil</td>
<td>210.32</td>
<td>8515.77</td>
<td>2055.51</td>
<td>S.America</td>
<td>1822-09-07</td>
</tr>
<tr>
<th>PAK</th>
<td>Pakistan</td>
<td>205.71</td>
<td>881.91</td>
<td>302.14</td>
<td>Asia</td>
<td>1947-08-14</td>
</tr>
<tr>
<th>NGA</th>
<td>Nigeria</td>
<td>200.96</td>
<td>923.77</td>
<td>375.77</td>
<td>Africa</td>
<td>1960-10-01</td>
</tr>
<tr>
<th>BGD</th>
<td>Bangladesh</td>
<td>167.09</td>
<td>147.57</td>
<td>245.63</td>
<td>Asia</td>
<td>1971-03-26</td>
</tr>
<tr>
<th>RUS</th>
<td>Russia</td>
<td>146.79</td>
<td>17098.2</td>
<td>1530.75</td>
<td>NaN</td>
<td>1992-06-12</td>
</tr>
<tr>
<th>MEX</th>
<td>Mexico</td>
<td>126.58</td>
<td>1964.38</td>
<td>1158.23</td>
<td>N.America</td>
<td>1810-09-16</td>
</tr>
<tr>
<th>JPN</th>
<td>Japan</td>
<td>126.22</td>
<td>377.97</td>
<td>4872.42</td>
<td>Asia</td>
<td>NaN</td>
</tr>
<tr>
<th>DEU</th>
<td>Germany</td>
<td>83.02</td>
<td>357.11</td>
<td>3693.2</td>
<td>Europe</td>
<td>NaN</td>
</tr>
<tr>
<th>FRA</th>
<td>France</td>
<td>67.02</td>
<td>640.68</td>
<td>2582.49</td>
<td>Europe</td>
<td>1789-07-14</td>
</tr>
<tr>
<th>GBR</th>
<td>UK</td>
<td>66.44</td>
<td>242.5</td>
<td>2631.23</td>
<td>Europe</td>
<td>NaN</td>
</tr>
<tr>
<th>ITA</th>
<td>Italy</td>
<td>60.36</td>
<td>301.34</td>
<td>1943.84</td>
<td>Europe</td>
<td>NaN</td>
</tr>
<tr>
<th>ARG</th>
<td>Argentina</td>
<td>44.94</td>
<td>2780.4</td>
<td>637.49</td>
<td>S.America</td>
<td>1816-07-09</td>
</tr>
<tr>
<th>DZA</th>
<td>Algeria</td>
<td>43.38</td>
<td>2381.74</td>
<td>167.56</td>
<td>Africa</td>
<td>1962-07-05</td>
</tr>
<tr>
<th>CAN</th>
<td>Canada</td>
<td>37.59</td>
<td>9984.67</td>
<td>1647.12</td>
<td>N.America</td>
<td>1867-07-01</td>
</tr>
<tr>
<th>AUS</th>
<td>Australia</td>
<td>25.47</td>
<td>7692.02</td>
<td>1408.68</td>
<td>Oceania</td>
<td>NaN</td>
</tr>
<tr>
<th>KAZ</th>
<td>Kazakhstan</td>
<td>18.53</td>
<td>2724.9</td>
<td>159.41</td>
<td>Asia</td>
<td>1991-12-16</td>
</tr>
</tbody>
</table>
This file shows the DataFrame
contents nicely. However, notice that you haven’t obtained an entire web page. You’ve just output the data that corresponds to df
in the HTML format.
.to_html()
won’t create a file if you don’t provide the optional parameter buf
, which denotes the buffer to write to. If you leave this parameter out, then your code will return a string as it did with .to_csv()
and .to_json()
.
Here are some other optional parameters:
header
determines whether to save the column names.index
determines whether to save the row labels.classes
assigns cascading style sheet (CSS) classes.render_links
specifies whether to convert URLs to HTML links.table_id
assigns the CSSid
to thetable
tag.escape
decides whether to convert the characters<
,>
, and&
to HTML-safe strings.
You use parameters like these to specify different aspects of the resulting files or strings.
You can create a DataFrame
object from a suitable HTML file using read_html()
, which will return a DataFrame
instance or a list of them:
>>> df = pd.read_html('data.html', index_col=0, parse_dates=['IND_DAY'])
This is very similar to what you did when reading CSV files. You also have parameters that help you work with dates, missing values, precision, encoding, HTML parsers, and more.
Excel Files
You’ve already learned how to read and write Excel files with Pandas. However, there are a few more options worth considering. For one, when you use .to_excel()
, you can specify the name of the target worksheet with the optional parameter sheet_name
:
>>> df = pd.DataFrame(data=data).T
>>> df.to_excel('data.xlsx', sheet_name='COUNTRIES')
Here, you create a file data.xlsx
with a worksheet called COUNTRIES
that stores the data. The string 'data.xlsx'
is the argument for the parameter excel_writer
that defines the name of the Excel file or its path.
The optional parameters startrow
and startcol
both default to 0
and indicate the upper left-most cell where the data should start being written:
>>> df.to_excel('data-shifted.xlsx', sheet_name='COUNTRIES',
... startrow=2, startcol=4)
Here, you specify that the table should start in the third row and the fifth column. You also used zero-based indexing, so the third row is denoted by 2
and the fifth column by 4
.
Now the resulting worksheet looks like this:
As you can see, the table starts in the third row 2
and the fifth column E
.
.read_excel()
also has the optional parameter sheet_name
that specifies which worksheets to read when loading data. It can take on one of the following values:
- The zero-based index of the worksheet
- The name of the worksheet
- The list of indices or names to read multiple sheets
- The value
None
to read all sheets
Here’s how you would use this parameter in your code:
>>>>>> df = pd.read_excel('data.xlsx', sheet_name=0, index_col=0,
... parse_dates=['IND_DAY'])
>>> df = pd.read_excel('data.xlsx', sheet_name='COUNTRIES', index_col=0,
... parse_dates=['IND_DAY'])
Both statements above create the same DataFrame
because the sheet_name
parameters have the same values. In both cases, sheet_name=0
and sheet_name='COUNTRIES'
refer to the same worksheet. The argument parse_dates=['IND_DAY']
tells Pandas to try to consider the values in this column as dates or times.
There are other optional parameters you can use with .read_excel()
and .to_excel()
to determine the Excel engine, the encoding, the way to handle missing values and infinities, the method for writing column names and row labels, and so on.
SQL Files
Pandas IO tools can also read and write databases. In this next example, you’ll write your data to a database called data.db
. To get started, you’ll need the SQLAlchemy package. To learn more about it, you can read the official ORM tutorial. You’ll also need the database driver. Python has a built-in driver for SQLite.
You can install SQLAlchemy with pip:
$ pip install sqlalchemy
You can also install it with Conda:
$ conda install sqlalchemy
Once you have SQLAlchemy installed, import create_engine()
and create a database engine:
>>> from sqlalchemy import create_engine
>>> engine = create_engine('sqlite:///data.db', echo=False)
Now that you have everything set up, the next step is to create a DataFrame
vật. It’s convenient to specify the data types and apply .to_sql()
.
>>> dtypes = {'POP': 'float64', 'AREA': 'float64', 'GDP': 'float64',
... 'IND_DAY': 'datetime64'}
>>> df = pd.DataFrame(data=data).T.astype(dtype=dtypes)
>>> df.dtypes
COUNTRY object
POP float64
AREA float64
GDP float64
CONT object
IND_DAY datetime64[ns]
dtype: object
.astype()
is a very convenient method you can use to set multiple data types at once.
Once you’ve created your DataFrame
, you can save it to the database with .to_sql()
:
>>> df.to_sql('data.db', con=engine, index_label='ID')
The parameter con
is used to specify the database connection or engine that you want to use. The optional parameter index_label
specifies how to call the database column with the row labels. You’ll often see it take on the value ID
, Id
, or id
.
You should get the database data.db
with a single table that looks like this:
The first column contains the row labels. To omit writing them into the database, pass index=False
to .to_sql()
. The other columns correspond to the columns of the DataFrame
.
There are a few more optional parameters. For example, you can use schema
to specify the database schema and dtype
to determine the types of the database columns. You can also use if_exists
, which says what to do if a database with the same name and path already exists:
if_exists='fail'
raises a ValueError and is the default.if_exists='replace'
drops the table and inserts new values.if_exists='append'
inserts new values into the table.
You can load the data from the database with read_sql()
:
>>> df = pd.read_sql('data.db', con=engine, index_col='ID')
>>> df
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
ID
CHN China 1398.72 9596.96 12234.78 Asia NaT
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.39 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
RUS Russia 146.79 17098.25 1530.75 None 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaT
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaT
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaT
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaT
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaT
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
The parameter index_col
specifies the name of the column with the row labels. Note that this inserts an extra row after the header that starts with ID
. You can fix this behavior with the following line of code:
>>> df.index.name = None
>>> df
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
CHN China 1398.72 9596.96 12234.78 Asia NaT
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.39 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
RUS Russia 146.79 17098.25 1530.75 None 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaT
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaT
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaT
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaT
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaT
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
Now you have the same DataFrame
object as before.
Note that the continent for Russia is now None
instead of nan
. If you want to fill the missing values with nan
, then you can use .fillna()
:
>>> df.fillna(value=float('nan'), inplace=True)
.fillna()
replaces all missing values with whatever you pass to value
. Here, you passed float('nan')
, which says to fill all missing values with nan
.
Also note that you didn’t have to pass parse_dates=['IND_DAY']
to read_sql()
. That’s because your database was able to detect that the last column contains dates. However, you can pass parse_dates
if you’d like. You’ll get the same results.
There are other functions that you can use to read databases, like read_sql_table()
and read_sql_query()
. Feel free to try them out!
Pickle Files
Pickling is the act of converting Python objects into byte streams. Unpickling is the inverse process. Python pickle files are the binary files that keep the data and hierarchy of Python objects. They usually have the extension .pickle
or .pkl
.
You can save your DataFrame
in a pickle file with .to_pickle()
:
>>> dtypes = {'POP': 'float64', 'AREA': 'float64', 'GDP': 'float64',
... 'IND_DAY': 'datetime64'}
>>> df = pd.DataFrame(data=data).T.astype(dtype=dtypes)
>>> df.to_pickle('data.pickle')
Like you did with databases, it can be convenient first to specify the data types. Then, you create a file data.pickle
to contain your data. You could also pass an integer value to the optional parameter protocol
, which specifies the protocol of the pickler.
You can get the data from a pickle file with read_pickle()
:
>>> df = pd.read_pickle('data.pickle')
>>> df
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
CHN China 1398.72 9596.96 12234.78 Asia NaT
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.39 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
RUS Russia 146.79 17098.25 1530.75 NaN 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaT
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaT
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaT
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaT
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaT
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
read_pickle()
returns the DataFrame
with the stored data. You can also check the data types:
>>> df.dtypes
COUNTRY object
POP float64
AREA float64
GDP float64
CONT object
IND_DAY datetime64[ns]
dtype: object
These are the same ones that you specified before using .to_pickle()
.
As a word of caution, you should always beware of loading pickles from untrusted sources. This can be dangerous! When you unpickle an untrustworthy file, it could execute arbitrary code on your machine, gain remote access to your computer, or otherwise exploit your device in other ways.
Working With Big Data
If your files are too large for saving or processing, then there are several approaches you can take to reduce the required disk space:
- Compress your files
- Choose only the columns you want
- Omit the rows you don’t need
- Force the use of less precise data types
- Split the data into chunks
You’ll take a look at each of these techniques in turn.
Compress and Decompress Files
You can create an archive file like you would a regular one, with the addition of a suffix that corresponds to the desired compression type:
'.gz'
'.bz2'
'.zip'
'.xz'
Pandas can deduce the compression type by itself:
>>>>>> df = pd.DataFrame(data=data).T
>>> df.to_csv('data.csv.zip')
Here, you create a compressed .csv
file as an archive. The size of the regular .csv
file is 1048 bytes, while the compressed file only has 766 bytes.
You can open this compressed file as usual with the Pandas read_csv()
function:
>>> df = pd.read_csv('data.csv.zip', index_col=0,
... parse_dates=['IND_DAY'])
>>> df
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
CHN China 1398.72 9596.96 12234.78 Asia NaT
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.39 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
RUS Russia 146.79 17098.25 1530.75 NaN 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaT
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaT
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaT
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaT
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaT
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
read_csv()
decompresses the file before reading it into a DataFrame
.
You can specify the type of compression with the optional parameter compression
, which can take on any of the following values:
'infer'
'gzip'
'bz2'
'zip'
'xz'
None
The default value compression='infer'
indicates that Pandas should deduce the compression type from the file extension.
Here’s how you would compress a pickle file:
>>>>>> df = pd.DataFrame(data=data).T
>>> df.to_pickle('data.pickle.compress', compression='gzip')
You should get the file data.pickle.compress
that you can later decompress and read:
>>> df = pd.read_pickle('data.pickle.compress', compression='gzip')
df
again corresponds to the DataFrame
with the same data as before.
You can give the other compression methods a try, as well. If you’re using pickle files, then keep in mind that the .zip
format supports reading only.
Choose Columns
The Pandas read_csv()
and read_excel()
functions have the optional parameter usecols
that you can use to specify the columns you want to load from the file. You can pass the list of column names as the corresponding argument:
>>> df = pd.read_csv('data.csv', usecols=['COUNTRY', 'AREA'])
>>> df
COUNTRY AREA
0 China 9596.96
1 India 3287.26
2 US 9833.52
3 Indonesia 1910.93
4 Brazil 8515.77
5 Pakistan 881.91
6 Nigeria 923.77
7 Bangladesh 147.57
8 Russia 17098.25
9 Mexico 1964.38
10 Japan 377.97
11 Germany 357.11
12 France 640.68
13 UK 242.50
14 Italy 301.34
15 Argentina 2780.40
16 Algeria 2381.74
17 Canada 9984.67
18 Australia 7692.02
19 Kazakhstan 2724.90
Now you have a DataFrame
that contains less data than before. Here, there are only the names of the countries and their areas.
Instead of the column names, you can also pass their indices:
>>>>>> df = pd.read_csv('data.csv',index_col=0, usecols=[0, 1, 3])
>>> df
COUNTRY AREA
CHN China 9596.96
IND India 3287.26
USA US 9833.52
IDN Indonesia 1910.93
BRA Brazil 8515.77
PAK Pakistan 881.91
NGA Nigeria 923.77
BGD Bangladesh 147.57
RUS Russia 17098.25
MEX Mexico 1964.38
JPN Japan 377.97
DEU Germany 357.11
FRA France 640.68
GBR UK 242.50
ITA Italy 301.34
ARG Argentina 2780.40
DZA Algeria 2381.74
CAN Canada 9984.67
AUS Australia 7692.02
KAZ Kazakhstan 2724.90
Expand the code block below to compare these results with the file 'data.csv'
:
,COUNTRY,POP,AREA,GDP,CONT,IND_DAY
CHN,China,1398.72,9596.96,12234.78,Asia,
IND,India,1351.16,3287.26,2575.67,Asia,1947-08-15
USA,US,329.74,9833.52,19485.39,N.America,1776-07-04
IDN,Indonesia,268.07,1910.93,1015.54,Asia,1945-08-17
BRA,Brazil,210.32,8515.77,2055.51,S.America,1822-09-07
PAK,Pakistan,205.71,881.91,302.14,Asia,1947-08-14
NGA,Nigeria,200.96,923.77,375.77,Africa,1960-10-01
BGD,Bangladesh,167.09,147.57,245.63,Asia,1971-03-26
RUS,Russia,146.79,17098.25,1530.75,,1992-06-12
MEX,Mexico,126.58,1964.38,1158.23,N.America,1810-09-16
JPN,Japan,126.22,377.97,4872.42,Asia,
DEU,Germany,83.02,357.11,3693.2,Europe,
FRA,France,67.02,640.68,2582.49,Europe,1789-07-14
GBR,UK,66.44,242.5,2631.23,Europe,
ITA,Italy,60.36,301.34,1943.84,Europe,
ARG,Argentina,44.94,2780.4,637.49,S.America,1816-07-09
DZA,Algeria,43.38,2381.74,167.56,Africa,1962-07-05
CAN,Canada,37.59,9984.67,1647.12,N.America,1867-07-01
AUS,Australia,25.47,7692.02,1408.68,Oceania,
KAZ,Kazakhstan,18.53,2724.9,159.41,Asia,1991-12-16
You can see the following columns:
- The column at index
0
contains the row labels. - The column at index
1
contains the country names. - The column at index
3
contains the areas.
Simlarly, read_sql()
has the optional parameter columns
that takes a list of column names to read:
>>> df = pd.read_sql('data.db', con=engine, index_col='ID',
... columns=['COUNTRY', 'AREA'])
>>> df.index.name = None
>>> df
COUNTRY AREA
CHN China 9596.96
IND India 3287.26
USA US 9833.52
IDN Indonesia 1910.93
BRA Brazil 8515.77
PAK Pakistan 881.91
NGA Nigeria 923.77
BGD Bangladesh 147.57
RUS Russia 17098.25
MEX Mexico 1964.38
JPN Japan 377.97
DEU Germany 357.11
FRA France 640.68
GBR UK 242.50
ITA Italy 301.34
ARG Argentina 2780.40
DZA Algeria 2381.74
CAN Canada 9984.67
AUS Australia 7692.02
KAZ Kazakhstan 2724.90
Again, the DataFrame
only contains the columns with the names of the countries and areas. If columns
is None
or omitted, then all of the columns will be read, as you saw before. The default behavior is columns=None
.
Omit Rows
When you test an algorithm for data processing or machine learning, you often don’t need the entire dataset. It’s convenient to load only a subset of the data to speed up the process. The Pandas read_csv()
and read_excel()
functions have some optional parameters that allow you to select which rows you want to load:
skiprows
: either the number of rows to skip at the beginning of the file if it’s an integer, or the zero-based indices of the rows to skip if it’s a list-like objectskipfooter
: the number of rows to skip at the end of the filenrows
: the number of rows to read
Here’s how you would skip rows with odd zero-based indices, keeping the even ones:
>>>>>> df = pd.read_csv('data.csv', index_col=0, skiprows=range(1, 20, 2))
>>> df
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaN
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaN
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
In this example, skiprows
is range(1, 20, 2)
and corresponds to the values 1
, 3
, …, 19
. The instances of the Python built-in class range
behave like sequences. The first row of the file data.csv
is the header row. It has the index 0
, so Pandas loads it in. The second row with index 1
corresponds to the label CHN
, and Pandas skips it. The third row with the index 2
and label IND
is loaded, and so on.
If you want to choose rows randomly, then skiprows
can be a list or NumPy array with pseudo-random numbers, obtained either with pure Python or with NumPy.
Force Less Precise Data Types
If you’re okay with less precise data types, then you can potentially save a significant amount of memory! First, get the data types with .dtypes
again:
>>> df = pd.read_csv('data.csv', index_col=0, parse_dates=['IND_DAY'])
>>> df.dtypes
COUNTRY object
POP float64
AREA float64
GDP float64
CONT object
IND_DAY datetime64[ns]
dtype: object
The columns with the floating-point numbers are 64-bit floats. Each number of this type float64
consumes 64 bits or 8 bytes. Each column has 20 numbers and requires 160 bytes. You can verify this with .memory_usage()
:
>>> df.memory_usage()
Index 160
COUNTRY 160
POP 160
AREA 160
GDP 160
CONT 160
IND_DAY 160
dtype: int64
.memory_usage()
returns an instance of Series
with the memory usage of each column in bytes. You can conveniently combine it with .loc[]
and .sum()
to get the memory for a group of columns:
>>> df.loc[:, ['POP', 'AREA', 'GDP']].memory_usage(index=False).sum()
480
This example shows how you can combine the numeric columns 'POP'
, 'AREA'
, and 'GDP'
to get their total memory requirement. The argument index=False
excludes data for row labels from the resulting Series
vật. For these three columns, you’ll need 480 bytes.
You can also extract the data values in the form of a NumPy array with .to_numpy()
or .values
. Then, use the .nbytes
attribute to get the total bytes consumed by the items of the array:
>>> df.loc[:, ['POP', 'AREA', 'GDP']].to_numpy().nbytes
480
The result is the same 480 bytes. So, how do you save memory?
In this case, you can specify that your numeric columns 'POP'
, 'AREA'
, and 'GDP'
should have the type float32
. Use the optional parameter dtype
to do this:
>>> dtypes = {'POP': 'float32', 'AREA': 'float32', 'GDP': 'float32'}
>>> df = pd.read_csv('data.csv', index_col=0, dtype=dtypes,
... parse_dates=['IND_DAY'])
The dictionary dtypes
specifies the desired data types for each column. It’s passed to the Pandas read_csv()
function as the argument that corresponds to the parameter dtype
.
Now you can verify that each numeric column needs 80 bytes, or 4 bytes per item:
>>>>>> df.dtypes
COUNTRY object
POP float32
AREA float32
GDP float32
CONT object
IND_DAY datetime64[ns]
dtype: object
>>> df.memory_usage()
Index 160
COUNTRY 160
POP 80
AREA 80
GDP 80
CONT 160
IND_DAY 160
dtype: int64
>>> df.loc[:, ['POP', 'AREA', 'GDP']].memory_usage(index=False).sum()
240
>>> df.loc[:, ['POP', 'AREA', 'GDP']].to_numpy().nbytes
240
Each value is a floating-point number of 32 bits or 4 bytes. The three numeric columns contain 20 items each. In total, you’ll need 240 bytes of memory when you work with the type float32
. This is half the size of the 480 bytes you’d need to work with float64
.
In addition to saving memory, you can significantly reduce the time required to process data by using float32
instead of float64
in some cases.
Use Chunks to Iterate Through Files
Another way to deal with very large datasets is to split the data into smaller chunks and process one chunk at a time. If you use read_csv()
, read_json()
or read_sql()
, then you can specify the optional parameter chunksize
:
>>> data_chunk = pd.read_csv('data.csv', index_col=0, chunksize=8)
>>> type(data_chunk)
<class 'pandas.io.parsers.TextFileReader'>
>>> hasattr(data_chunk, '__iter__')
True
>>> hasattr(data_chunk, '__next__')
True
chunksize
defaults to None
and can take on an integer value that indicates the number of items in a single chunk. When chunksize
is an integer, read_csv()
returns an iterable that you can use in a for
loop to get and process only a fragment of the dataset in each iteration:
>>> for df_chunk in pd.read_csv('data.csv', index_col=0, chunksize=8):
... print(df_chunk, end='\n\n')
... print('memory:', df_chunk.memory_usage().sum(), 'bytes',
... end='\n\n\n')
...
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
CHN China 1398.72 9596.96 12234.78 Asia NaN
IND India 1351.16 3287.26 2575.67 Asia 1947-08-15
USA US 329.74 9833.52 19485.39 N.America 1776-07-04
IDN Indonesia 268.07 1910.93 1015.54 Asia 1945-08-17
BRA Brazil 210.32 8515.77 2055.51 S.America 1822-09-07
PAK Pakistan 205.71 881.91 302.14 Asia 1947-08-14
NGA Nigeria 200.96 923.77 375.77 Africa 1960-10-01
BGD Bangladesh 167.09 147.57 245.63 Asia 1971-03-26
memory: 448 bytes
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
RUS Russia 146.79 17098.25 1530.75 NaN 1992-06-12
MEX Mexico 126.58 1964.38 1158.23 N.America 1810-09-16
JPN Japan 126.22 377.97 4872.42 Asia NaN
DEU Germany 83.02 357.11 3693.20 Europe NaN
FRA France 67.02 640.68 2582.49 Europe 1789-07-14
GBR UK 66.44 242.50 2631.23 Europe NaN
ITA Italy 60.36 301.34 1943.84 Europe NaN
ARG Argentina 44.94 2780.40 637.49 S.America 1816-07-09
memory: 448 bytes
COUNTRY POP AREA GDP CONT IND_DAY
DZA Algeria 43.38 2381.74 167.56 Africa 1962-07-05
CAN Canada 37.59 9984.67 1647.12 N.America 1867-07-01
AUS Australia 25.47 7692.02 1408.68 Oceania NaN
KAZ Kazakhstan 18.53 2724.90 159.41 Asia 1991-12-16
memory: 224 bytes
In this example, the chunksize
is 8
. The first iteration of the for
loop returns a DataFrame
with the first eight rows of the dataset only. The second iteration returns another DataFrame
with the next eight rows. The third and last iteration returns the remaining four rows.
Lưu ý: You can also pass iterator=True
to force the Pandas read_csv()
function to return an iterator object instead of a DataFrame
đối tượng.
In each iteration, you get and process the DataFrame
with the number of rows equal to chunksize
. It’s possible to have fewer rows than the value of chunksize
in the last iteration. You can use this functionality to control the amount of memory required to process data and keep that amount reasonably small.
Kết luận
You now know how to save the data and labels from Pandas DataFrame
objects to different kinds of files. You also know how to load your data from files and create DataFrame
objects.
You’ve used the Pandas read_csv()
and .to_csv()
methods to read and write CSV files. You also used similar methods to read and write Excel, JSON, HTML, SQL, and pickle files. These functions are very convenient and widely used. They allow you to save or load your data in a single function or method call.
You’ve also learned how to save time, memory, and disk space when working with large data files:
- Compress or decompress files
- Choose the rows and columns you want to load
- Use less precise data types
- Split data into chunks and process them one by one
You’ve mastered a significant step in the machine learning and data science process! If you have any questions or comments, then please put them in the comments section below.